Hengitystievirusten nukleiinihapon osoitukseen
tarkoitetuilla multiplex-menetelmillä haasteita
4/2017 Moodi 7
TEKSTI: NIINA KIVI, LABQUALITY
Multiplex-menetelmien käyttö
diagnostiikassa on yleistynyt
viime vuosina nopeaan tahtiin.
Vuoden 2015 Moodin Mikrobiologia
teemaisessa numerossa
(Moodi 4-5/2015) Erkki Eerola ja Tytti
Vuorinen esittelivät artikkeleissaan hengitystieinfektioita
aiheuttavien bakteereiden
ja virusten multiplex-PCR -tutkimuksia sekä
saatavilla olevia kaupallisia kittejä. Erilaisten
kittien määrä on jo tästä kuluneen kahden
vuoden aikana lisääntynyt merkittävästi.
Nukleiinihapon osoitusmenetelmien määrä
Labqualityn ulkoisen laadunarvioinnin kierroksilla
on myös kasvanut.
Tähän kasvavaan kysyntään vastataksemme
olemmekin viime vuosina lisänneet tarjontaa
nukleiinihapon osoitusmenetelmille,
ja ensi vuodesta alkaen myös kierroksia erityisesti
multiplex-menetelmille.
Mitkä multiplex-menetelmät?
Multiplex-menetelmät ovat käytännöllisiä
mm. hengitystieinfektioita aiheuttavien taudinaiheuttajien
seulontatutkimuksiin. Tällaisten
menetelmien avulla samanlaisia oireita
aiheuttavien taudinaiheuttajien erotteludiagnostiikka
tapahtuu nopeasti, ja hoidon
aloittamisen viiveet lyhenevät verrattuna yksittäisten
taudinaiheuttajien tunnistusmenetelmiä
käytettävään diagnostiikkaan. Useiden
patogeenien tunnistaminen samanaikaisesti
tosin saattaa aiheuttaa haasteita menetelmien
herkkyydessä ja tarkkuudessa. Siksi
onkin ensisijaisen tärkeää huomioida kunkin
tutkimusmenetelmän erityispiirteet laadunarvioinnin
suunnittelussa, ja käyttää menetelmäkohtaisesti
kliinisesti merkittäviä
näytteitä ulkoisessa laadunarvioinnissa.
Yllättäviä tuloksia
ensimmäiseltä kierrokselta
Labquality on pitkään järjestänyt influenssavirusten
A- ja B- sekä RS-viruksen osoituskierroksia
soveltuen sekä antigeeni- että
nukleiinihapon osoitusmenetelmille. Nukleiinihapon
osoitusmenetelmiä käyttävien
osallistujamäärien lisääntyessä aloitimme
tämän vuoden alusta erillisen influenssa A-,
influenssa B- ja RS-virusten multiplex-minipaneelin
toimittamisen - tarkoituksena palvella
paremmin kyseisten virusten nukleiinihapon
osoitusmenetelmiä käyttäviä asiakkaita.
Nukleiinihapon osoitusmenetelmien
tulokset osoituskierroksilla ovatkin olleet
pääasiassa hyviä. Tosin tiedossa on ollut,
että näiden kierrosten näytemateriaali on
ollut herkille nukleiinihapon osoitusmenetelmille
helppo. Tämä uutuuskierros antoikin
hieman enemmän haastetta testien suorituskyvylle
aikaisempiin, kaikille menetelmille
tarkoitettuihin, kierroksiin verrattuna.
Tämän vuoden ensimmäisen kierroksen
tulosyhteenvedon perusteella näyte S003
osoittautui jopa niin haasteelliseksi, että sitä
ei pisteytetty RSV:n detektion osalta. Näytteessä
S003 oli vanhaa A-ryhmän tyyppikantaa
(Randall). Myös toisen RSV-positiivisen
näytteen S001 onnistumisaste oli alhainen,
82,9 %. Näytteessä S001 oli B-ryhmään
kuuluvaa kliinistä isolaattia vuodelta 2012.
RSV-näytteiden ennakkotestausten kynnysarvojen
perusteella tulos oli yllättävä. Suurin
osa vääristä tuloksista näytteistä S001
ja S003 osui eniten käytetylle menetelmälle,
jolla RSV:n löytymisaste oli 57,5 % (23/40),
kun se muilla menetelmillä yhteenlaskettuna
oli 80 % (24/30). Influenssavirusnäytteiden
ja negatiivisen näytteen osalta tulos oli erinomainen,
ja virheitä voidaan pitää sattumanvaraisina.
Samoja RSV- ja influenssaviruskantoja
kaikille menetelmille sopivina laimennoksina
on käytetty aiemmillakin osoituskierroksilla
erinomaisin tuloksin.
Tämän kierroksen tulokset yllättivät, mutta
toisaalta myös vahvistivat nukleiinihapon
osoitusmenetelmille suunnattujen kierrosten
tärkeyttä – erityisesti multiplex-menetelmien
osalta. Erilaisten menetelmien spesifisyyttä
kliinisesti merkittävien viruskantojen tunnistamisessa
on syytä seurata säännöllisesti.
Kuin myös preanalyyttisten vaiheiden tarkasteluun
on näiden erittäin herkkien menetelmien
osalta syytä kiinnittää erityistä huomiota.
AJANKOHTAISTA
Labqualityn kierrosvalikoima laajenee ensi vuonna kolmella täysin uudentyyppisellä
kierroksella, jotka ovat tarkoitettu multiplex-menetelmien laadunvarmistukseen.
• 5300 Hengitystieinfektiot multiplex, nukleiinihapon osoitus
• 5191 Ulosteen bakteeripatogeenit multiplex, nukleiinihapon osoitus
• 5302 Sukupuolitaudit multiplex, nukleiinihapon osoitus
Muistathan myös minipaneelimme:
• 5670 Influenssavirus A+B ja RS-virus, nukleiinihapon osoitus
• 5472 Giardia ja Cryptosporidium, nukleiinihapon osoitus
• 5612 Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihapon osoitus
LISÄTIETOJA:
Myynti ja asiakaspalvelu
puh. 09 8566 8200
info@labquality.fi
KUVA: SHUTTERSTOCK
link